东方医药网提醒我国医改虽然取得阶段性成就，但全民健康保障体系覆盖的广度、深度、高度还远远不够，医保基金正成为国内医疗机构的主要收入来源，如何在保证供给的同时控制费用，成为医保基金面临的重大挑战。
虽然全民医保已经走出了第一步，广大参保人都希望在全民医保之下，医疗保障水平能够有更大的提高。医保基金当前面临的最大挑战是我国进入老龄化社会。目前退休人员占百分之二十四点九，占用了住院费用的百分之五十九点九。
医保越来越成为医疗机构的主要收入来源，但保障和控制的双重责任在增加。同时，虽然医保基金是医疗机构与参保者利益的总体代表，但医保服务机构满足参保者便捷性需求和防范欺诈风险的双重责任加重，医保管理机构对信息的集中和日益精细的管理与确保信息安全的双重责任加重。
全国60岁以上的老年人有1.85亿，而且每年以百分之零点五的速度在提升，医保基金支出压力持续增大。虽然据了解，我国全民医保目前尚存在重复参保、虚报人头等现象。据推算，城镇居民重复参保率为百分之十。此外，全民医保的公平性有待改善。
我国全民医保体系已经建立起来，但是保障体系碎片化、保障层次差距大、重复参保等问题明显，我国的全民医保与发达国家相比，还有巨大的差距。尤其是人口老龄化趋势的不断加强，我国的全民医保正面临着前所未有的挑战。