按照国务院食品安全办等五部门《关于印发畜禽水产品抗生素、禁用化合物及兽药残留超标专项整治行动方案的通知》（食安办〔2016〕15号）和内蒙古自治区食品药品安全办等六部门《关于印发内蒙古自治区畜禽水产品抗生素、禁用化合物及兽药残留超标专项整治行动实施方案的通知》（内食药安办〔2016〕51号）要求，内蒙古于2017年4月1日至10月31日开展了畜禽水产品抗生素、禁用化合物及兽药残留超标专项整治行动，并取得了阶段性成果。
一是确定检查重点，思路清晰。各级食品药品监管部门将人口密度较高、历次检验检测问题较多、风险隐患较大的食品超市、农贸市场、畜禽水产品专卖店等销售企业作为检查的重点目标，将城乡结合部、农村牧区列为检查重点区域。对《2016年农业部对我区呼和浩特等盟市全年监测情况通报》（内农牧质发〔2017〕19号）中涉及检验检测风险较高的盟市，加大了监督检查和抽检力度。
二是实施集中整治，覆盖广泛。通过监督检查和监督抽检，有力督促了集中交易市场开办者认真履行畜禽水产品市场准入、信息公示、监督抽检或者快速检测等义务，引导销售者加强自律，建立并落实进货查验记录等制度，保证畜禽水产品来源可查。整治期间，全区共检查集中交易市场276家（其中批发市场56家、零售市场220家），检查畜禽水产品销售者10397户（其中商场或超市1985户、便利店3333户、其他5061户），检查餐饮服务者707户，开展监督抽检（抽样检验）2591批次（其中畜禽屠宰环节172批次、水产品生产环节37批次、畜禽水产品销售环节2356批次、餐饮服务环节26批次），查处销售违法畜禽水产品案件1件，受理和处理消费者投诉和举报9件。
三是打造共治格局，氛围浓厚。整治期间，各级食品药品监管部门协调主流媒体充分发挥宣传作用，全力营造浓厚的宣传舆论氛围。通过报刊、广播电视、网络及时向社会公众通报工作部署和进展情况，宣传专项整治行动成果，主动解答社会咨询，回应社会关切，引导社会公众积极参与专项整治行动中，共治共享食品安全。同时，曝光典型案例，公布对违法失信企业的查处情况，对违法犯罪分子形成有力震慑。